課程資訊
課程名稱
生物資訊學導論
Introduction to Bioinformatics 
開課學期
108-1 
授課對象
生物資源暨農學院  農藝學系  
授課教師
劉力瑜 
課號
Agron5050 
課程識別碼
621 U6390 
班次
 
學分
3.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期五6,7,8(13:20~16:20) 
上課地點
 
備註
教室:生物產業自動化中心(鄭江樓505室)與陳虹諺合授
總人數上限:45人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1081Agron5050_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程介紹生物資訊學相關技術與資料分析方法。考量生物資訊學隨生物技術快速發展迅息萬變,課程內容主要來自近年最新發表的期刊論文,配合利用自由軟體 (open source software,如:R、Bioconductor等) 進行實際資料分析的演練。內容包含: (A) Introduction, (B) Microarray data analysis, (C) Sequence analysis, and (D) Advanced topics.  

課程目標
使學生對生物技術原理有概念性的了解,並具備實際資料分析與解釋其生物意義的基礎能力。Introduce current status of development of bioinformatics technologies through lecturing and paper readings. 
課程要求
homework 100% (兩位老師各半) 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
待補 
參考書目
待補 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
homework 
100% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
9/13  Holiday 
第2週
9/20  Introduction (Liu) 
第3週
9/27  Related statistical concepts (Chen) 
第4週
10/04  R and Bioconductor (Liu) 
第5週
10/11  Holiday 
第6週
10/18  Hypothesis testing (Chen) 
第7週
10/25  Microarray Techniques (Chen) 
第8週
11/01  Microarray Data Normalization & Visualization (Chen) 
第9週
11/08  Identify of Gene Signatures (Chen) 
第10週
11/15  Holiday 
第11週
11/22  Class Discovery (Chen) 
第12週
11/29  Class Prediction (Chen) 
第13週
12/06  AffylmGUI / practice (Liu) 
第14週
12/13  Modern Sequencing Methods; DESeq for RNA-Seq (Liu) 
第15週
12/20  Sequence Alignment & Assembly (Liu) 
第16週
12/27  Polymorphisms and Comparative Genomics (Liu) 
第17週
1/03  Networks (Liu) 
第18週
1/10  Gene Ontology and Annotation (Liu)